La gifle

Il y a bien longtemps… Un pauvre se disputa avec un riche. Le ton monta et, sans, plus de préambule, le riche gifla le pauvre. Celui-ci, qui ne comptait pas se laisser faire, porta l’affaire devant le juge. Le juge écouta les deux plaignants et décida que l’homme riche donnerait en dédommagement à l’homme pauvre, un…

Shotgun sequencing

For sequencing long DNA, even an entire chromosome. Not reliable in case of DNA with lots of repetitions (need to use the sequencing method based on BACs). Steps Random DNA fragmenation (restriction enzymes or physical fragmenation) Sequencing of individual fragments. Assembly of the fragments sequences by computer on the basis of their overlapping regions.

RACE PCR

On connait la séquence codante du gène étudier , donc de l’ATG au codon stop. on ne connait pas les extrémités 5’UTR et 3’UTR de l’ARNm   5′ RACE PCR: but = amplifier uniquement la région  5’UTR de l’ARNm, en passant par l’ADNc. cela permet ensuite de ne séquencer que cette région au lieu de…

La démarche transcriptome

 But: déterminer le profil de transcription des gène d’un organisme donné dans une condition donnée, ou comparer le profil de transcription d’un meme organisme dans différentes conditions et diterminer ainsi les gènes dont la transcription est lié à une condition donnée. Etapes: Prélèvement d’un échantillon, ou culture, de cellules en condition A et d’autres en…